MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 chromosome

Total Repeats: 106449

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013743	ACG	2	6	148	153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013743	GAC	2	6	161	166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163296
3	NC_013743	CGG	2	6	220	225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163296
4	NC_013743	CGA	2	6	256	261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163296
5	NC_013743	GAGCC	2	10	263	272	20 %	0 %	40 %	40 %	284163296
6	NC_013743	CGA	2	6	283	288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163296
7	NC_013743	GCG	2	6	297	302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163296
8	NC_013743	AGG	2	6	321	326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163296
9	NC_013743	GATCA	2	10	371	380	40 %	20 %	20 %	20 %	284163296
10	NC_013743	CGA	2	6	390	395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163296
11	NC_013743	TCG	2	6	399	404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163296
12	NC_013743	CAA	2	6	595	600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284163296
13	NC_013743	GAA	2	6	610	615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284163296
14	NC_013743	CGA	2	6	628	633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163296
15	NC_013743	CGA	2	6	640	645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163296
16	NC_013743	GCT	2	6	655	660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163296
17	NC_013743	CCA	2	6	684	689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284163296
18	NC_013743	GCGGAC	2	12	692	703	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	284163296
19	NC_013743	GCC	2	6	704	709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163296
20	NC_013743	CGA	2	6	739	744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163296
21	NC_013743	GAC	3	9	773	781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163296
22	NC_013743	CCGGC	2	10	807	816	0 %	0 %	40 %	60 %	284163296
23	NC_013743	CGAA	2	8	852	859	50 %	0 %	25 %	25 %	284163296
24	NC_013743	CGA	2	6	886	891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163296
25	NC_013743	GAC	3	9	956	964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163296
26	NC_013743	CCGAT	2	10	1018	1027	20 %	20 %	20 %	40 %	284163296
27	NC_013743	ACC	2	6	1041	1046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284163296
28	NC_013743	CCTCG	2	10	1048	1057	0 %	20 %	20 %	60 %	284163296
29	NC_013743	GAG	2	6	1127	1132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163296
30	NC_013743	CCGA	2	8	1151	1158	25 %	0 %	25 %	50 %	284163296
31	NC_013743	TCT	2	6	1173	1178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284163296
32	NC_013743	ACG	2	6	1194	1199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163296
33	NC_013743	GTC	3	9	1205	1213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163296
34	NC_013743	TCG	2	6	1239	1244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163296
35	NC_013743	AGA	2	6	1245	1250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284163296
36	NC_013743	GCG	2	6	1251	1256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163296
37	NC_013743	ATC	2	6	1316	1321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284163296
38	NC_013743	GAG	3	9	1385	1393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163296
39	NC_013743	ACG	2	6	1410	1415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163296
40	NC_013743	GCG	2	6	1467	1472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163296
41	NC_013743	TG	3	6	1497	1502	0 %	50 %	50 %	0 %	284163296
42	NC_013743	CG	3	6	1531	1536	0 %	0 %	50 %	50 %	284163296
43	NC_013743	CG	3	6	1538	1543	0 %	0 %	50 %	50 %	284163296
44	NC_013743	CCT	2	6	1549	1554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163296
45	NC_013743	TCG	2	6	1599	1604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163296
46	NC_013743	CGT	2	6	1648	1653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163296
47	NC_013743	ATC	2	6	1703	1708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284163296
48	NC_013743	GAG	2	6	1778	1783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163296
49	NC_013743	TCA	2	6	1824	1829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284163296
50	NC_013743	CGT	3	9	1861	1869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163296
51	NC_013743	GAG	2	6	1922	1927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163296
52	NC_013743	TCC	2	6	1938	1943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163296
53	NC_013743	CGA	2	6	1969	1974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163296
54	NC_013743	ACG	2	6	2135	2140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163297
55	NC_013743	CTC	2	6	2215	2220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163297
56	NC_013743	TCG	2	6	2240	2245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163297
57	NC_013743	GTC	2	6	2281	2286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163297
58	NC_013743	TCGA	2	8	2350	2357	25 %	25 %	25 %	25 %	284163297
59	NC_013743	CGA	2	6	2379	2384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163297
60	NC_013743	GAG	2	6	2401	2406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163297
61	NC_013743	GATC	2	8	2427	2434	25 %	25 %	25 %	25 %	284163297
62	NC_013743	TCC	2	6	2435	2440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163297
63	NC_013743	CGT	2	6	2475	2480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163297
64	NC_013743	ACG	2	6	2494	2499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163297
65	NC_013743	TCG	2	6	2537	2542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163297
66	NC_013743	ACG	2	6	2543	2548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163297
67	NC_013743	CGAT	2	8	2552	2559	25 %	25 %	25 %	25 %	284163297
68	NC_013743	CCGA	2	8	2560	2567	25 %	0 %	25 %	50 %	284163297
69	NC_013743	GCGACG	2	12	2579	2590	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	284163297
70	NC_013743	CGA	2	6	2628	2633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163297
71	NC_013743	CTG	2	6	2671	2676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_013743	CG	3	6	2784	2789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_013743	GC	4	8	2830	2837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_013743	TAG	2	6	2888	2893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013743	CCG	2	6	2981	2986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163298
76	NC_013743	GGCC	2	8	3101	3108	0 %	0 %	50 %	50 %	284163298
77	NC_013743	CCG	2	6	3129	3134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163298
78	NC_013743	GAC	2	6	3215	3220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163298
79	NC_013743	GTC	3	9	3222	3230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163298
80	NC_013743	CGT	2	6	3286	3291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163298
81	NC_013743	GATG	2	8	3400	3407	25 %	25 %	50 %	0 %	284163298
82	NC_013743	CCG	2	6	3416	3421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163298
83	NC_013743	TTG	2	6	3462	3467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284163298
84	NC_013743	CGA	2	6	3538	3543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163298
85	NC_013743	CGA	2	6	3559	3564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163298
86	NC_013743	AGATC	2	10	3565	3574	40 %	20 %	20 %	20 %	284163298
87	NC_013743	GCG	2	6	3622	3627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163298
88	NC_013743	CGC	2	6	3634	3639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163298
89	NC_013743	CGA	2	6	3670	3675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163298
90	NC_013743	GCT	2	6	3683	3688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163298
91	NC_013743	TCG	3	9	3717	3725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163298
92	NC_013743	ACG	2	6	3744	3749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163298
93	NC_013743	CGT	2	6	3751	3756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163298
94	NC_013743	CGT	2	6	3772	3777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163298
95	NC_013743	CGT	2	6	3785	3790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163298
96	NC_013743	CGC	2	6	3791	3796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163298
97	NC_013743	CCGTC	2	10	3804	3813	0 %	20 %	20 %	60 %	284163298
98	NC_013743	CGG	2	6	3826	3831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163298
99	NC_013743	TCG	2	6	3864	3869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163298
100	NC_013743	TCG	2	6	3891	3896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163298
101	NC_013743	GTC	2	6	3899	3904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163298
102	NC_013743	CAAT	2	8	3959	3966	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_013743	CGT	2	6	4019	4024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_013743	TCG	2	6	4045	4050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_013743	AAT	2	6	4059	4064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013743	TGG	2	6	4070	4075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013743	TCG	2	6	4140	4145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_013743	GGC	2	6	4268	4273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163299
109	NC_013743	CGT	2	6	4283	4288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163299
110	NC_013743	GTC	2	6	4314	4319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163299
111	NC_013743	GACC	2	8	4322	4329	25 %	0 %	25 %	50 %	284163299
112	NC_013743	GCCG	2	8	4394	4401	0 %	0 %	50 %	50 %	284163299
113	NC_013743	CCG	2	6	4405	4410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163299
114	NC_013743	CGGG	2	8	4447	4454	0 %	0 %	75 %	25 %	284163299
115	NC_013743	G	6	6	4475	4480	0 %	0 %	100 %	0 %	284163299
116	NC_013743	CCGA	2	8	4489	4496	25 %	0 %	25 %	50 %	284163299
117	NC_013743	TCG	2	6	4579	4584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163299
118	NC_013743	CGGG	2	8	4628	4635	0 %	0 %	75 %	25 %	284163299
119	NC_013743	ACC	2	6	4639	4644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284163299
120	NC_013743	CGG	2	6	4673	4678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163299
121	NC_013743	TGA	2	6	4783	4788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284163299
122	NC_013743	CGA	2	6	4814	4819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163299
123	NC_013743	ACT	2	6	4820	4825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284163299
124	NC_013743	CGA	2	6	4829	4834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163299
125	NC_013743	GAC	2	6	4863	4868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163299
126	NC_013743	TCG	2	6	4882	4887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163299
127	NC_013743	GGC	2	6	4952	4957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163299
128	NC_013743	CCT	2	6	5060	5065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163299
129	NC_013743	GGCGTC	2	12	5088	5099	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	284163299
130	NC_013743	TCG	2	6	5128	5133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163299
131	NC_013743	AGA	2	6	5173	5178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284163299
132	NC_013743	TGA	2	6	5200	5205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284163299
133	NC_013743	ACG	2	6	5218	5223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163299
134	NC_013743	CGA	2	6	5255	5260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163299
135	NC_013743	GAA	2	6	5391	5396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284163299
136	NC_013743	ACG	2	6	5407	5412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163299
137	NC_013743	GGA	2	6	5516	5521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163299
138	NC_013743	GCT	2	6	5602	5607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163299
139	NC_013743	AGA	2	6	5629	5634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284163299
140	NC_013743	TCG	2	6	5671	5676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163299
141	NC_013743	AGG	2	6	5835	5840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013743	TGG	2	6	5843	5848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013743	CG	3	6	5849	5854	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_013743	GGC	2	6	5857	5862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_013743	GGCC	2	8	5880	5887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_013743	GCA	2	6	5969	5974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_013743	GAG	2	6	5980	5985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013743	GGA	2	6	5997	6002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013743	CCT	2	6	6128	6133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163300
150	NC_013743	TCG	2	6	6182	6187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163300
151	NC_013743	TCC	2	6	6239	6244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163300
152	NC_013743	ATCG	2	8	6314	6321	25 %	25 %	25 %	25 %	284163300
153	NC_013743	CG	3	6	6320	6325	0 %	0 %	50 %	50 %	284163300
154	NC_013743	CGC	2	6	6339	6344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163300
155	NC_013743	TCG	2	6	6351	6356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163300
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159	NC_013743	CGT	2	6	6459	6464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163300
160	NC_013743	CGA	2	6	6584	6589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_013743	TGC	2	6	6611	6616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_013743	CGG	2	6	6617	6622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_013743	CGAT	2	8	6692	6699	25 %	25 %	25 %	25 %	284163301
164	NC_013743	CGA	2	6	6710	6715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163301
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166	NC_013743	CGGC	2	8	6732	6739	0 %	0 %	50 %	50 %	284163301
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172	NC_013743	CTC	2	6	6942	6947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163301
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186	NC_013743	CGAG	2	8	7466	7473	25 %	0 %	50 %	25 %	284163301
187	NC_013743	CG	3	6	7508	7513	0 %	0 %	50 %	50 %	284163301
188	NC_013743	TCT	2	6	7519	7524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284163301
189	NC_013743	TGCG	2	8	7532	7539	0 %	25 %	50 %	25 %	284163301
190	NC_013743	TCGGAG	2	12	7638	7649	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
191	NC_013743	TCG	2	6	7738	7743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163302
192	NC_013743	CGA	2	6	7898	7903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163302
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194	NC_013743	GCT	2	6	8024	8029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163302
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202	NC_013743	TCG	2	6	8347	8352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163303
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245	NC_013743	CGG	2	6	9944	9949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163303
246	NC_013743	G	6	6	9996	10001	0 %	0 %	100 %	0 %	284163304
247	NC_013743	ATT	2	6	10022	10027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284163304
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250	NC_013743	CTG	2	6	10131	10136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163305
251	NC_013743	CCA	2	6	10173	10178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284163305
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254	NC_013743	GCG	2	6	10345	10350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163305
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256	NC_013743	CACC	2	8	10530	10537	25 %	0 %	0 %	75 %	284163305
257	NC_013743	CGT	2	6	10541	10546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163305
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260	NC_013743	AGT	2	6	10613	10618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284163305
261	NC_013743	GTC	2	6	10659	10664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163305
262	NC_013743	CGA	3	9	10670	10678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163305
263	NC_013743	TGT	2	6	10745	10750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284163305
264	NC_013743	CTTT	2	8	10778	10785	0 %	75 %	0 %	25 %	284163305
265	NC_013743	CGCTC	2	10	10813	10822	0 %	20 %	20 %	60 %	284163305
266	NC_013743	TCG	2	6	10927	10932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163305
267	NC_013743	GACC	2	8	10949	10956	25 %	0 %	25 %	50 %	284163305
268	NC_013743	CGG	2	6	10967	10972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163305
269	NC_013743	CGT	2	6	11066	11071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163305
270	NC_013743	CTC	2	6	11073	11078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163305
271	NC_013743	TCC	2	6	11149	11154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163305
272	NC_013743	GTCT	2	8	11248	11255	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
273	NC_013743	GTC	2	6	11276	11281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_013743	CTC	2	6	11309	11314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
275	NC_013743	CCT	3	9	11350	11358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163306
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277	NC_013743	TCG	2	6	11415	11420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163306
278	NC_013743	CTC	2	6	11459	11464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163306
279	NC_013743	TCC	2	6	11484	11489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163306
280	NC_013743	CTC	2	6	11495	11500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163306
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282	NC_013743	CGA	2	6	11648	11653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163306
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285	NC_013743	CGA	2	6	11752	11757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163306
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287	NC_013743	ACG	2	6	11877	11882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163306
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289	NC_013743	TCG	2	6	11935	11940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163306
290	NC_013743	GTT	2	6	11945	11950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284163306
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313	NC_013743	TCG	2	6	13075	13080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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335	NC_013743	ATTC	2	8	13744	13751	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
336	NC_013743	TCCG	2	8	13773	13780	0 %	25 %	25 %	50 %	284163308
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371	NC_013743	ACCG	2	8	14855	14862	25 %	0 %	25 %	50 %	284163309
372	NC_013743	CGGA	2	8	14863	14870	25 %	0 %	50 %	25 %	284163309
373	NC_013743	CCG	2	6	14874	14879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163309
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382	NC_013743	ATC	2	6	15254	15259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284163309
383	NC_013743	TCC	2	6	15276	15281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163309
384	NC_013743	GC	3	6	15297	15302	0 %	0 %	50 %	50 %	284163309
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390	NC_013743	CTG	2	6	15464	15469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163309
391	NC_013743	TCC	2	6	15486	15491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163309
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500	NC_013743	GACG	2	8	18634	18641	25 %	0 %	50 %	25 %	284163312

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